但同時也有相關學者提出了針對血吸蟲病的疑問，首先他們指出，同樣參加赤壁之戰(zhàn)，唯獨曹軍被血吸蟲感染了，為何吳軍卻沒有呢？僅僅用免疫力就能說明這一點嗎？他們還相繼提出了針對以上理由的反駁。

　　反對者首先指出，曹操是在鄴而不是在疫區(qū)江陵訓練水軍的，而鄴并不是血吸蟲病疫區(qū)，感染的可能性不是很大。其次在潛伏期上，反對者也指出，血吸蟲病的潛伏期一般在一個月左右，少數(shù)在兩個月以上，但潛伏期越長，發(fā)病的癥狀也就越輕。因此他們認為，即使曹軍是在秋季患上了血吸蟲病，那么等到大戰(zhàn)爆發(fā)前的冬季才發(fā)病的曹軍癥狀應該相對較輕，而不至于毫無抵抗力。

　　對歷史上確實有曹操燒船退軍一事的記載，他們也指出了錯誤之處。因為燒船的地點不在赤壁而在巴丘，時間不在赤壁大戰(zhàn)時，而在曹軍兵敗退到巴丘時。對于提出的免疫力問題，反對者也作出了解釋，說曹操的水軍大部分是居于血吸蟲病流行區(qū)的湖北人，跟孫劉聯(lián)軍的免疫力沒有什么差別；除此之外，補充給曹操的劉璋軍隊也是來自疫區(qū)四川的士卒。所以，孫劉聯(lián)軍在免疫能力上與曹軍沒有高低強弱的分別，因此也就不存在只有曹軍患血吸蟲病的可能了。

　　曾經(jīng)被人稱為用兵如神的曹操吃了個大敗仗，讓人不免感到疑惑，也許正是因為這一理由，人們才喜歡按照自己的想法去研究，或許真相并沒有那么復雜，只是人們太愛去追尋所謂的根源了。